Το εμβόλιο κατά του καρκίνου του τραχήλου προστατεύει τη γυναίκα από δυο τύπους του HPV που ευθύνονται για το 70% των περιπτώσεων. Επομένως, ενώ παρέχει σημαντική προστασία δεν αποκλείει το ενδεχόμενο προσβολής από τον HPV.
Συμφώνα με τις διεθνείς οδηγίες ο εμβολιασμός είναι αποτελεσματικότερος όταν γίνετε σε κορίτσια στην προ-εφηβεία 12-13 ετών. Ωστόσο η ασφάλεια και η αποτελεσματικότητα του εμβολίου έχει αποδεδειχθεί και σε μεγαλύτερες γυναίκες (έως 24 ετών) που δεν είχαν σεξουαλικές επαφές. Μια γυναίκα που έχει σεξουαλικές επαφές μπορεί να εμβολιαστεί με ασφάλεια, ωστόσο επειδή μπορεί να έχει εκτεθεί ήδη στους συγκεκριμένους τύπους του HPV είναι πιθανόν το εμβόλιο να μη βοηθήσει. Πρέπει να τονιστεί ότι το εμβόλιο δεν έχει καμία θεραπευτική δράση. Επιπλέον, ο εμβολιασμός δεν αντικαθιστά τον ετήσιο έλεγχο με το τεστ-παπ.